1958年9月1日，绍兴制药厂前身绍兴粮食制品厂成立。

1970年，生物发酵法试制味精、土霉素取得成功，并获准生产； 1972年10月，正式改名为“绍兴制药厂”。

1997年7月1日，绍兴制药厂与浙江震元股份有限公司强强联合，更名为“浙江震元制药有限公司”。1999年，公司被认定为国家重点高新技术企业。2000至2001年，公司非无菌原料药车间、制剂车间、冻干粉针剂车间相继通过国家GMP认证。

2002年12月26日，原料药生产线迁建至袍江工业区投产运行。随后，获得了公司第一个国家二类新药、第一个国家发明专利、第一个国际PCT发明专利，成为国际上第一家通过硫酸奈替米星COS认证的企业，部分产品通过欧盟相关国家GMP认证及美国FDA检查。2016年，制剂生产线也全部落地袍江。

2023年9月28日，震元制药原料药集聚提升项目取得施工许可证，原料药生产基地异地搬迁上虞正式动工，开启“匠心做药、创新筑梦”未来新篇章。预计于2026年投产。